Функции Агентства по защите депозитов Кыргызской Республики:

• сбор и учет взносов для формирования Фонда защиты депозитов;
• ведение реестра банков-участников, микрофинансовых компаний-участников, жилищно-сберегательных кредитных компаний-участников;
• учет сумм, подлежащих к выплате, и сумм, компенсаций по депозитам;
• выплата компенсационных сумм вкладчикам приемлемыми способами при наступлении гарантийного случая;
• размещение свободных средств Фонда защиты депозитов и привлечение заемных и иных средств в случае их недостатка для выплаты вкладчикам компенсационных сумм;
• расчет размера взносов на основе отчетности и сбор взносов банков-участников, микрофинансовых компаний-участников, жилищно-сберегательных кредитных компаний-участников в Фонд защиты депозитов;
• установление соответствия в банках-участниках, микрофинансовых компаниях-участниках, жилищно-сберегательных кредитных компаниях-участниках системы защиты депозитов базы данных вкладчиков определенным требованиям;
• внутренний контроль;
• осуществление отбора банка-агента в целях обеспечения выплаты компенсаций по вкладам;
• обеспечение возмещения выплаченных компенсаций в Фонд защиты депозитов с ликвидируемого банка, микрофинансовой компании, жилищно-сберегательной кредитной компании в соответствии с Законом Кыргызской Республики «О защите банковских вкладов (депозитов)»;
• проведение мероприятий по повышению осведомленности общества о системе защиты депозитов